他克莫司常见的副作用有神经系统、血液系统、胃肠道系统、心血管系统、代谢与营养、全身反应等方面的异常。

1、神经系统：常见的有头痛、震颤，感觉异常，有少数人服用此药后可引起癫痫。

2、血液系统：常见的有贫血、继发性血小板减少、白细胞增多、少数人可引起纯红细胞再生障碍性贫血。

3、胃肠道系统：腹泻、恶心、呕吐、腹痛。

4、心血管系统：常见有高血压、QT间期延长，严重者可引起心房颤动甚至心脏骤停、心肌肥大、充血性心力衰竭、心肌梗死等。

5、代谢与营养方面异常：低镁血症（24%）、低磷血症（28%）、高钾血症（26%）、高血糖血症（21%）、高脂血症（18%）、低钾血症（16%）。

6、全身反应：服用此药后可产生术后疼痛、切口部位产生其他并发症、移植后功能障碍、周边水肿、失眠、尿路感染、血清肌酐升高。